La inceputul secolului 20, intr-o realitate unde alchimia este reala, extrem de bine dezvoltata si respectata, doi frati pe nume Edward si Alphonse incearca o tehnica interzisa de transmutare umana si sufera niste consecinte teribile. Alphonse isi pierde intregul corp in timp ce Edward doar piciorul stang. Edward isi sacrifica apoi si mana dreapta pentru a putea sa salveze sufletul fratelui sau atasandu-l la o armura din metal. Edward primeste apoi proteze metalice in locul membrelor care ii lipsesc. El primeste apoi porecla de „alchimistul de metal” si se afla intr-o continua cautare a unei legendare pietre a filosofului despre care se spune ca ar avea puterea de-a le repara trupurile.